Подробное описание документа
А. О. Ковалинская
Интегрированный анализ мультиомиксных данных в гематоонкологии : студенческая научная работа / А. О. Ковалинская. - Дубна : б. и., 2023. -
Генетические и эпигенетические изменения часто связаны с развитием и прогрессированием рака, и понимание этих изменений может помочь определить новые мишени для диагностики, прогнозирования и терапии рака. Целью данной работы является автоматизация процесса поиска функций генов в двух типах рака — диффузной В-крупноклеточной лимфоме и остром миелоидном лейкозе, в зависимости от способов регуляции их экспрессии. Разработанное программное обеспечение, реализованное в виде Jupyter-блокнота, включает в себя разделение генов на категории в зависимости от факторов, влияющих на их экспрессию, проведение функциональной аннотации каждой из групп и определение уровня микроРНК для генов, не входящих в группы. Для реализации алгоритмического блока использовались методы регрессионного анализа, поиск ассоциативных правил, корреляция Пирсона из библиотек на Python и R. Репозиторий [https://github.com/lateNighter/multiomics] распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International.
